できます。
以下の手順で、伝票番号を使用しないように設定できます。
設定を変更すると、以後入力する仕訳の伝票番号は表示されなくなります。
この設定の前に入力されていた仕訳の伝票番号は、灰色の表示となり、入力されていないのと同様の扱いとなります。